As obras da Transcarioca enfrentaram os desafios da execução em uma área urbana, localizada em áreas de alto fluxo de circulação da população. A criação de canaletas segregadas por onde circularam veículos articulados exigiu, nos trechos de tráfego mais pesado, a construção de mergulhões (na Barra da Tijuca) e no acesso entre Campinho e Madureira.
Além disso, diversos imóveis em bairros como a Barra da Tijuca, em Jacarepaguá, Madureira, Vicente de Carvalho e Brás de Pina, entre outros bairros, precisaram ser desapropriados integralmente ou parcialmente para viabilizar o corredor de transporte.